Big data gaan ziektes bij individuen voorspellen

Door de genetische en niet-genetische informatie, zoals de samenstelling van het microbioom, in een computermodel te stoppen, konden onderzoekers van het Radboudumc en UMCG voorspellen of proefpersonen een adequate afweerreactie ontwikkelen tegen bepaalde infecties.

Voor het onderzoek, gepubliceerd in Nature Immunology (21 mei 2018), werd de afweerreactie van 500 proefpersonen uit het Human Functional Genomics Project bekeken. Van deze mensen werden bloedcellen geïsoleerd, waaraan in het laboratorium ziekteverwekkers werden toegevoegd. Vervolgens werd de aanmaak van cytokines door de bloedcellen gemeten. De onderzoekers vergeleken de uitkomsten van de cytokinemetingen met een zeer grote hoeveelheid medische data van de 500 individuen, waardoor zij konden vaststellen welke factoren de aanmaak van cytokines, en daarmee een goede afweerreactie, het sterkst beïnvloedden. 

 De genetische aanleg van de proefpersonen bleek de belangrijkste factor te zijn die de afweerrespons reguleert. “We hebben een rekenkundig model ontwikkeld dat op basis van al deze beschikbare ‘big data’  voorspelde welke individuen een adequate afweerrespons zouden ontwikkelen tegen bepaalde infecties”, zegt hoogleraar Mihai Netea. Het model wees uit dat de capaciteit om cytokines te produceren correleerde met het voorspelde genetische risico op de ontwikkeling van complexe ziekten. Onderzoeker Yang Li: “Het is de verwachting dat we met behulp van dit soort modellen in de toekomst kunnen voorspellen welke individuen beschermd zijn tegen infecties, en wie moet oppassen en misschien voorzorgsmaatregelen moet nemen.”

 (Bron: Radboudumc, 22 mei 2018)