Indien een (hernieuwde) conventionele wortelkanaalbehandeling niet mogelijk of niet succesvol is, kan een chirurgische apicale endodontische behandeling zijn geïndiceerd. De tegenwoordig striktere indicatiestelling, de betere retrograde preparatietechnieken door onder andere ultrasone preparatie met retrotips en de betere visualisering van het operatiegebied met een operatiemicroscoop kunnen leiden tot hogere succespercentages. Bovendien zijn de huidige ontwikkelingen op het gebied van biocompatibele vulmaterialen voor de klinische toepassing als retrograde afsluiting veelbelovend. Ook de toepassing van lasers is veelbelovend, maar moet zijn echte nut nog bewijzen.